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/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9410p.zip / M94A3279.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-10-25  |  2KB  |  35 lines
  1.        Document 3279
  2.  DOCN  M94A3279
  3.  TI    Darwinian evolution operates on the V3 region of HIV within a single
  4.        host.
  5.  DT    9412
  6.  AU    Yamaguchi Y; Gojobori T; National Institute of Genetics, Shizuoka,
  7.        Japan.
  8.  SO    Int Conf AIDS. 1994 Aug 7-12;10(1):112 (abstract no. PA0066). Unique
  9.        Identifier : AIDSLINE ICA10/94369296
  10.  AB    OBJECTIVE: The purpose of this study is to elucidate the mechanisms of
  11.        molecular evolution of the third variable envelope (V3) region for HIV
  12.        within a single host. In particular, we intend to examine the patterns
  13.        of nucleotide substitutions in this region to see whether positive
  14.        selection is operating on the V3 region. METHODS: We constructed
  15.        phylogenetic trees by use of nucleotide sequences of HIV within a host.
  16.        We examined whether nonsynonymous (amino acid altering) substitutions
  17.        are occurring with a frequency higher than synonymous (silent)
  18.        substitutions. RESULTS: Our statistical test showed that for the V3
  19.        region, the average number of nonsynonymous substitutions was
  20.        significantly larger than that of synonymous substitutions. It suggests
  21.        that Darwinian evolution is operating on the V3 region. For the entire
  22.        env gene, however, the number of synonymous substitutions was larger
  23.        than that of nonsynonymous substitutions, implying that neutral
  24.        evolution is occurring in the entire env gene. DISCUSSION AND
  25.        CONCLUSIONS: Our observations indicate that Darwinian evolution may be
  26.        operating on the V3 region for HIV, although neutral evolution is
  27.        occuring in the entire env gene.
  28.  DE    *Evolution  *Genes, env  Human  HIV/*GENETICS/ISOLATION & PURIF  HIV
  29.        Envelope Protein gp120/*GENETICS  HIV Infections/MICROBIOLOGY  Peptide
  30.        Fragments/*GENETICS  Phylogeny  Variation (Genetics)  MEETING ABSTRACT
  31.  
  32.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  33.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  34.  
  35.